Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ABCC1P33527 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCC1P33527 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms