Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APOBEC3AP31941 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APOBEC3AP31941 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms