Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXA13P31271 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA13P31271 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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