Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
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PTPRMP28827 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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PTPRMP28827 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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PTPRMP28827 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
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PTPRMP28827 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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PTPRMP28827 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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PTPRMP28827 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
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PTPRMP28827 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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PTPRMP28827 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
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PTPRMP28827 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPRMP28827 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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