Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PTAFRP25105 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTAFRP25105 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms