Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LAMA2P24043 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms