Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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