Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
GCSHP23434 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
GCSHP23434 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
GCSHP23434 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms