Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HNF1AP20823 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms