Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HOXB9P17482 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB9P17482 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms