Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB3P16520 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB3P16520 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB3P16520 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB3P16520 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB3P16520 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB3P16520 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB3P16520 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB3P16520 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB3P16520 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB3P16520 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB3P16520 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB3P16520 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB3P16520 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GNB3P16520 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GNB3P16520 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GNB3P16520 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GNB3P16520 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms