Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD8P13378 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD8P13378 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms