Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN1P12814 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN1P12814 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN1P12814 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN1P12814 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN1P12814 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACTN1P12814 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms