Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAPPC2BP0DI82 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms