Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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PKHD1P08F94 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PKHD1P08F94 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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