Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEFMP07197 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEFMP07197 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEFMP07197 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEFMP07197 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFMP07197 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFMP07197 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFMP07197 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFMP07197 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFMP07197 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFMP07197 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFMP07197 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFMP07197 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFMP07197 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFMP07197 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFMP07197 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEFMP07197 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEFMP07197 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEFMP07197 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEFMP07197 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEFMP07197 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEFMP07197 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEFMP07197 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEFMP07197 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NEFMP07197 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFMP07197 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFMP07197 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFMP07197 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFMP07197 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFMP07197 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFMP07197 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFMP07197 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEFMP07197 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms