Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DOAP06340 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DOAP06340 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms