Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATG7O95352 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATG7O95352 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATG7O95352 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATG7O95352 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG7O95352 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATG7O95352 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATG7O95352 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG7O95352 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATG7O95352 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms