Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN7O94888 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms