Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC22O60826 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC22O60826 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms