Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
HTRA2O43464 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms