Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POLR1CO15160 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms