Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf172C9J069 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms