Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RTL1A6NKG5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RTL1A6NKG5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms