Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00862A6NCI5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00862A6NCI5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms