Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VPS37CA5D8V6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms