Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMEM89A2RUT3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEM89A2RUT3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms