Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC-0.27□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
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