Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SKIV2LQ15477 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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