Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.89
BRD3Q15059 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BRD3Q15059 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms