Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NFX1Q12986 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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