Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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KCNMA1Q12791 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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KCNMA1Q12791 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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KCNMA1Q12791 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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KCNMA1Q12791 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
KCNMA1Q12791 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
KCNMA1Q12791 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
KCNMA1Q12791 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KCNMA1Q12791 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
KCNMA1Q12791 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
KCNMA1Q12791 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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