Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTPREP23469 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTPREP23469 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPREP23469 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPREP23469 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PTPREP23469 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPREP23469 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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