Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CTIFO43310 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CTIFO43310 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CTIFO43310 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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