Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMG1Q96Q15 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMG1Q96Q15 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
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