Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CSPP1Q1MSJ5 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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