Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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MKRN4PQ13434 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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MKRN4PQ13434 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
MKRN4PQ13434 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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MKRN4PQ13434 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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MKRN4PQ13434 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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MKRN4PQ13434 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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MKRN4PQ13434 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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MKRN4PQ13434 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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MKRN4PQ13434 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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MKRN4PQ13434 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
MKRN4PQ13434 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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