Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SOBPA7XYQ1 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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