Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TRIM63Q969Q1 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.2 ms