Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AL133232.1-201ENST00000458293 483 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 MIR1231-201ENST00000408101 92 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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