Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
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