Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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UBE4AQ14139 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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UBE4AQ14139 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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UBE4AQ14139 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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UBE4AQ14139 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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UBE4AQ14139 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
UBE4AQ14139 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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