Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CCINQ13939 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
CCINQ13939 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CCINQ13939 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
CCINQ13939 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
CCINQ13939 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
CCINQ13939 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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