Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms