Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PTPREP23469 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PTPREP23469 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTPREP23469 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms