Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
FOXQ1Q9C009 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
FOXQ1Q9C009 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms