Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPA17-204ENST00000532692 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-8Q9BYQ0 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms