Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GKAP1Q5VSY0 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GKAP1Q5VSY0 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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