Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
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BNIP3Q12983 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
BNIP3Q12983 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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BNIP3Q12983 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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BNIP3Q12983 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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BNIP3Q12983 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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BNIP3Q12983 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
BNIP3Q12983 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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