Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTPREP23469 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTPREP23469 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTPREP23469 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTPREP23469 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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PTPREP23469 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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PTPREP23469 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTPREP23469 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTPREP23469 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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